Bei aktuelleren MySQL-Installationen ist die Standard-Engine InnoDB und nicht mehr MyISAM.
Das kann gerade bei Typo3 dazu führen, dass die Datenbankzugriffe sehr langsam werden. Mit folgendem PHP-Script können alle Datenbanktabellen von InnoDB auf MyISAM geändert werden:

$db = mysql_connect('localhost','someadmin','somepass');
$dbs = array();
$dbs[] = 'databasename';
 
foreach($dbs as $v){
    mysql_select_db($v);
    $q = mysql_query('show tables');
    $tables = array();
    while($r = mysql_fetch_row($q)){
            $tables[] = $r[0];
    }
    foreach($tables as $t){
        echo "do $v.$t<br />\n";
        mysql_query('ALTER TABLE `'.$t.'` ENGINE=MyISAM;');
    }
}
mysql_close($db);

Dieses Script einfach in das Root-Verzeichnis der Webseite legen und aufrufen.
(Logo: die Platzhalter 'someadmin', 'somepass' und 'databasename' müssen vorher ersetzt werden )